Административный центр района - село Липин Бор.

Герб района утвержден 28 декабря 2001 году решением №72 комитета самоуправления Вашкинского муниципального района. Автор герба - Олег Свириденко (г.Вологда). Официальное описание герба:

"В серебряном поле - червленая княжеская шапка с горностаевой опушкой, сопровождаемая накрест четырьмя червлеными липами с такими же корнями и зеленой короной и четырьмя вкрест зелеными листьями липы над волнистой лазоревой оконечностью с золотой уклеей. В вольной части - герб Вологодской области".

Княжеская шапка на гербе напоминает легенду о том, что на северном берегу Белого озера был основан один из первых русских городов - Белоозеро в районе нынешнего села Киснема, первым князем которого был варяг Синеус. С IX-XIV веков территория Вашкинского района входила в состав отдельного Белозерского княжества. Дерево липа и лист липы символизируют районный центр - село Липин Бор, получившее свое название из-за зарослей лип в окрестностях села. Голубая оконечность символизирует Вашкозеро, давшее название селу Вашки и Вашкинскому району, которое в 30-е годы XX века в связи с работами по реконструкции Мариинского водоканала оказалось в зоне затопления. Золотая рыба уклейка указывает на название села Вашки и Вашкинского района, что в дословном переводе с вепсского означает "медная рыба". Золотой цвет рыбы перекликается с цветом меди.

Использованы материалы статьи О.Свириденко в газете "Русский север" (текст предоставлен Владимиром Марковым, Санкт-Петербург).