Герб Мышкина утвержден 20 июня 1778 года (закон №14765; 31 августа 1778) вместе с другими гербами Ярославского наместничества.

"В щите, имеющем зеленое поле, щиток надвое разрезанный: в серебряном поле герб Ярославский, в другой части в червленом поле мышка, доказывая название сего города".

Герб сочинен товарищем герольдмейстера фон Энденом.

Использованы материалы статьи О.Рево в журнале "Наука и жизнь" №10, 1978

Герб и флаг Мышкинского муниципального округа (они же герб и флаг города Мышкина) утверждены 30 мая 2002 года решением Собрания депутатов Мышкинского муниципального округа "О гербе и флаге Мышкинского муниципального округа". Согласно тексту этого решения:

"Статья 2.
За основу герба Мышкинского муниципального округа взят герб, разработанный и утвержденный в 1778 году.
Герб представляет собой следующую композицию:
Французский щит (прямоугольный с малым заострением внизу) заполнен зеленой эмалью. В центре содержит французский щиток (малый щит), разделенный на две части: верхнюю и нижнюю часть щита в соотношении 4:3.
В верхней части, заполненной серебряной эмалью (белой краской), размещено победренное изображение медведя коричневого цвета с секирой на левом плече. Секира – золотой эмали. В нижней части на червленой эмали (ярко-красной краске) – серая мышка. Обе фигуры, если встать лицом к гербу, идут влево.
За щитом герба два золотых якоря накрест положенных, с золотыми дубовыми листьями, соединенными Александровской (алой) лентой.
Щит украшен золотой башенной короной с тремя зубцами и увенчан императорской короной, которые соединенные вместе составляют одну корону.
Допускается воспроизведение герба Мышкинского муниципального округа в многоцветном и упрощенном черно-белом варианте без императорской короны и внешнего обрамления герба, с башенной короной.
Герб Мышкинского муниципального округа одновременно является гербом г. Мышкина". "

Использованы материалы сайта Аналитического центра Администрации Ярославской области