Прежние названия города - Новый Маргелан (1876-1910) и Скобелев (1910-1924) . В 1924 году принято название Фергана. Город входил в Ферганскую область Российской империи.

Герб Нового Маргелана утвержден 22 октября 1908 года вместе с другими гербами Ферганской области. Гербовый щит в точности повторял герб Ферганской области.