Район основан в 1928 году как Ленинский. В 1993 году переименован в Казыгуртский. Административный центр - село Казыгурт.

На гербе Казыгуртского района, одобренном районным Акиматом, изображен Ноев Ковчег. Согласно местной легенде библейский Ной после потопа пристал не к Арарату, а к горе Казыгурт. На склоне горы имеется "каменное образование, весьма похожее на днище огромной лодки". В котловине между двумя главами вершины из камней выложен круг диаметром 120 м, а в середине - 36-метровый крест. Этому памятнику зороастрийской культуры 2-2,5 тысячи лет.

Использовано изображение эмблемы на сервере Южно-казахстанской областной администрации и текст статьи Даура Досыбиева