В 1993 году Комиссия министерства обороны приняла флаг Сил обороны воздушного пространства. Это было голубое полотнище с эмблемой в центре. Эмблема представляла собой малый герб Украины в окружении венка из дуба и калины. Под эмблемой на ленте девиз "За Украину, за ее волю". Флаг имел золотую бахрому и кисти.

По сообщениям В.Напиткина в здании Министерства Обороны в Киеве был вывешен другой флаг Войск воздушной обороны, в центре помещалась вышеуказанная эмблема, но с крыльями.

В бюллетене Украинского геральдического общества "Знак" был предложен такой флаг ВВС - синее полотнище с жёлтым казацким крестом, в центре на синем медальоне золотой трезубец (авт.О.Кохан).

Использованы материалы бюллетеня УГО "Знак"

В 1997 году единые Силы обороны воздушного пространства были разделены на Военно-воздушные силы (ВВС) и Войска противовоздушной обороны (ПВО). Флаг для ВВС был предложен их командующим генералом-полковником В.Антонцом. За основу взяли флаг ВВС СССР, но в центре вместо красной звезды помещался сокол с пропеллером в когтях, а над ним трезубец.

Генерал-полковник О.Стеценко, командующий войск ПВО, выбрал для своего вида вооруженных сил существовавший до этого флаг Войск воздушной обороны (Сил обороны воздушного пространства). Но в центре полотнища были добавлены силуэты самолетов и ракет. Цвет полотнища изменился с голубого на синий.

Использованы материалы статьи В.Карпова в "ВІЙСЬКОВО-ІСТОРИЧНОМ АЛЬМАНАХЕ", №2, 2001
и фотоматериалы В.Напиткина (г.Хмельницкий)

Созданная в 2001 году военно-геральдическая служба предложила к утверждению президентом такой вариант флага ВВС: полотнище голубого цвета, в центре эмблема ВВС, отличающаяся от эмблемы ВС наличием золотого меча и двух золотых крыльев.

Для ПВО предложен синий флаг с эмблемой в центре.

Штандарты командующих ВВС и ПВО подобны флагам этих видов ВС, но имеют квадратную форму, оснащены бахромой и кистями.

Использованы материалы статьи А.Муравьева "Символика украинской армии" в "ВІЙСЬКОВО-ІСТОРИЧНОМ АЛЬМАНАХЕ", №3, 2001