29 сентября 1995 года утверждено Положение о гербе и флаге города Волгодонска. Флаг города Волгодонска состоит из трёх горизонтальных полос цветов флага Ростовской области: синей, жёлтой и красной. Жёлтая полоса выполнена в виде выщербленного пояса. На флаге также изображены два скрещенных бунчука (казацкие традиции) и якорь (важность порта Волгодонска). В центре жёлтой полосы изображён тюльпан, олицетворяющий природу донских степей.

Автор композиции герба и флага города - художник В.И.Николайчик