Флаг города Ханты-Мансийск представляет собой прямоугольное полотнище из трёх равных горизонтальных полос: голубой, белой и зелёной. В кантоне флага стилизованное изображение летящего былого журавля - стерха. Над силуэтом журавля три белые снежинки.

Длина полотнища вдвое больше его ширины.

Автор проекта флага - Е.Ю.Юрин. Флаг утверждён городской Думой 6 сентября 2000 года.

Использована информация сайта города Ханты-Мансийска

Во время трансляций Чемпионата мира по биатлону в Ханты-Мансийске (2003) на телеэкранах несколько раз появлялся гербовый флаг Ханты-Мансийска. Возможно, это официально утвержденный вариант.

Использован ресунок-реконструкция Паскаля Гросса (Швейцария)