Флаг Еткульского района утвержден постановлением районного Совета депутатов от 25 сентября 2002 года, №3. Описание флага:

"Прямоугольное полотнище с соотношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба: стоящую на зелёной земле белую каменную стену (без зубцов) с жёлтыми деревянной башней с закрытыми воротами и флюгером на островерхой кровле; в правом нижнем углу полотнища - набегающие на землю синие, тонко окаймленные белым остроконечные волны. В красной части полотнища слева от башни -белый повёрнутый куб".

Флаг разработан К.Моченовым (июея), Г.Туник (обоснование символики), С.Исаевым (компьютерный дизайн).

С любезного разрешения К.Ф.Мочёнова использованы материалы книги: К.Ф.Мочёнов, Г.А.Туник "Официальные символы Челябинской области и муниципальных образований"