Цивильск основан в 1589 году по распоряжению Бориса Годунова как город-крепость и получил имя от названия реки Цивиль. В 1781 году при образовании Казанского наместничества стал уездным городом.

29 мая 2002 года Цивильское районное Собрание депутатов приняло Решение "О флаге города Цивильск". Решение подписано Главой самоуправления Цивильского района Н.В.Евдокимовым. Положение о флаге, утвержденное вышеназванным Решением, рассмотрено и одобрено общим Cобранием жителей города 1 марта 2002 года. Согласно Положению о муниципальном флаге города Цивильска:

"2. Флаг города представляет собой: «Желтое (золотистое) полотнище с соотношением сторон 2:3, имеющее зеленую полосу вдоль нижнего края, занимающую 3/19 от ширины полотнища, и несущее посередине изображение вырастающего из зеленой полосы красного, с зеленой листвой и черными кряжами, стилизованного геральдического дуба». Символика флага города воспроизводит символику герба города".

Флаг города Цивильска является и флагом Цивильского района Чувашии. Герб Цивильска внесен в Государственный геральдический регистр под №966.

"Черный цвет означает историческую память народа. Красный цвет в геральдике символизирует труд, жизнеутверждающую силу, мужество, праздник, красоту. Зеленый означает достаток, процветание, стабильность. Желтый цвет (золотой) поля флага символизирует прочность, величие, богатство, силу и великодушие".

Использованы материалы сайта Администрации Цивильского района;
изображение флага любезно предоставлено В.Ломанцову автором флага - В.Шипуновым