Герб и флаг муниципального образования Бабушкинское утверждены решением №2/4 муниципального Собрания 9 марта 2004 года. Описание флага:

"Флаг муниципального образования Бабушкинское представляет собой двустороннее, прямоугольное полотнище с соотношением сторон 2:3.
В центре голубого полотнища помещены изображения расходящихся от центра желтых ветвей: обращенной к древку дубовой и лавровой. Габаритные размеры изображения составляют 59/60 длины и 1/10 ширины полотнища.
В верхней части полотнища помещено изображение белого, полуобращенного к древку, самолета-амфибии серии Ш-2. Габаритные размеры изображения составляют 11/24 длины и 3/10 ширины полотнища. Центр изображения равноудален от боковых краев полотнища и находится на расстоянии 1/5 ширины полотнища от его верхнего края.
В нижней части полотнища помещено прилегающее к нижнему краю полотнища изображение красно-зеленого пограничного столба, разделенного стропильно шесть раз, поверх которого белый молоток, обращенный вниз и к древку, перекрещенный с белым мечом острием вверх. Габаритные размеры изображения составляют 1/3 длины и 1/2 ширины полотнища. Центр изображения равноудален от боковых краев полотнища и находится на расстоянии 1/4 ширины полотнища от его нижнего края".

Серебряный самолет-амфибия серии Ш-2 символизирует заслуги знаменитого полярного летчика М.С.Бабушкина, в честь которого получило свое название МО. Пограничный столб символизирует Московский военный институт пограничных войск. Меч символизирует воинские части, военные научные учреждения и учебные заведения, в числе которых знаменитое Московское суворовское училище. Молоток символизирует расположение на территории муниципального образования ряда крупных промышленных предприятий. Дубовая и лавровая ветви символизируют воинскую и трудовую доблесть.

Использованы материалы официального сервера правительства Москвы