Флаг района Выхино-Жулебино повторяет композицию герба, утвержденного в 2002 году. На зеленом поле золотые лев с ветвью в пасти и лиса поддерживают золотую державу; глава щита лазуревая, отделенная от зеленого поля серебряной полоской, покрытой орнаментом. На сайте Управы района дается объяснение символики флага:
"Зеленое поле флага символизирует вотчины села Кусково - деревни Выхино и Жулебино, принадлежащие роду графов Шереметьевых. Синяя полоса и лента символизируют Кузьминские пруды. Фигура льва - деталь герба рода Шереметьевых - как символ власти, силы; фигура лиса - символ хитрости, дипломатии - характеризует управителя графских деревень Остеева А.Т., по прозвищу Жулеба (хитрец). "Содружество" льва и лиса, держащих Державу в своих руках - в данном случае как символ Университета Управления, расположенного на территории района. Серебряная глава в верхней части щита - фрагмент рисунка деревянной резьбой наличников домов деревень Выхино и Жулебино, давших название району".

Использованы материалы сайта Управы района Выхино-Жулебино